Kakashi et Danzou avaient tous deux obtenu physiquement leur Sharingan par transplantation.
Pendant la fin de la quatrième guerre mondiale de Shinobi, Madara arrache le Sharingan de Kakashi et lui transplante l'œil gauche Chapitre 674 ).
Naruto, utilisant le pouvoir de Hagaromo, crée un œil normal pour Kakashi Chapitre 675 ).
D'après l'article de Naruto Wikia sur Kakashi Hatake , résumé de l'intrigue fusionnée des chapitres 686, 687 et 688 (c'est moi qui souligne) :
Préparé à donner sa vie pour apporter le peu d'aide qu'il peut, Kakashi se tient devant Sasuke pour prendre l'attaque tandis qu'Obito fait de même pour Naruto. Bien qu'ils soient unis dans leur volonté de mourir, Obito décide qu'il est trop tôt pour Kakashi et utilise Kamui pour l'attaque qui lui est destinée, laissant Obito incapable de se sauver. Le corps d'Obito se dissout, mais son esprit revient peu après et habite Kakashi. Obito sent que Kakashi va devenir le prochain Hokage et souhaite le récompenser : un moment temporaire d'avoir deux Mangekyō Sharingan.
Obito a donné à Kakashi le privilège d'avoir les deux Sharingan (Mangekyou) temporairement. C'est l'esprit d'Obito qui a fait cela, et non le moi physique. Par conséquent, le Sharingan utilisé par Kakashi était influencé spirituellement.
Plus tard, lorsque Kaguya est vaincu, l'esprit d'Obito quitte le côté de Kakashi pour rejoindre l'autre monde. À cause de l'esprit qui part, le Sharingan disparaît également avec lui.
Si le Sharingan avait été physiquement présent, il serait resté, tout comme Danzou, le corbeau Kotoamatsukami et Kakashi d'avant-guerre.