La raison pour laquelle elle est différente n'est jamais vraiment énoncée, mais nous pouvons en déduire la raison.
Tout d'abord, il y a trois yeux différents dans Naruto. Du plus faible au plus fort, ce sont Byakugan, Sharingan et Rinnegan. Donc le byakugan restera un byakugan pour toujours, mais il peut se transformer en Tensaigan (je ne me souviens plus comment, mais cela n'a pas d'importance). Maintenant, pour les plus importants Rinnegan et Sharingan, Sharingan peut se transformer en Rinnegan. Cependant, avant cela, il faut trois choses : un Sharingan pleinement développé, 3 Tomoe Mangekyou, puis éternel.
Donc, pour ce qui est de ce qu'est le Rinnegan, c'est essentiellement un mélange d'un Sharingan et de ses propres traits, mais l'aspect Sharingan n'est utilisable que par les Uchihas. C'est pourquoi Nagato ne peut pas utiliser les effets du Sharingan, mais Sasuke et Madara le peuvent.
Maintenant, pour savoir pourquoi l'aspect de Sasuke est différent, Madara a pris le chakra Senju de Hashirama et l'a combiné avec le sien, ce qui a fait évoluer le Sharingan, ce qui est en quelque sorte la seule façon de faire évoluer un Sharingan, et Sasuke fait quelque chose de similaire, sauf que le sage des sixièmes voies donne à Sasuke la moitié de son chakra, ce qui est beaucoup plus que celui de Hashirama. Ainsi, ses yeux semblent presque se transformer en un Rinne Sharingan. De plus, la raison pour laquelle leurs capacités sont différentes est que c'est exactement comme ça que les rinegans travaillent, alors que les Mangekyou Sharingans font la même chose